平年に比べ偏西風が北に偏って流れ、太平洋高気圧が日本の東で強かったため、全国的に暖かい空気に覆われやすく、中旬を中心に南から暖かい空気が流れ込みやすかった。また、近海の海面水温が記録的に高かった。これらの影響で、月平均気温は全国的にかなり高かった。月平均気温偏差は、東日本で+3.1℃、西日本で+2.3℃と、1946年の統計開始以降、9月として東・西日本では1位の記録的な高温となった。北日本は、上・中旬を中心に前線や低気圧の影響を受けやすく、また、上旬には台風13号から変わった熱帯低気圧の影響で記録的な大雨の所もあり、月降水量が多かった。東・西日本では、前線や低気圧の影響を受けにくく、月降水量は東日本太平洋側で少なく、西日本太平洋側ではかなり少なかった。月間日照時間は東・西日本太平洋側で多かった。一方、上旬には台風13号と湿った空気の影響で、東日本太平洋側で記録的な大雨の所もあり、西日本では線状降水帯が発生して大雨の所もあった。沖縄・奄美では、中旬を中心に太平洋高気圧に覆われて晴れた日が多く、月降水量が少なく、月間日照時間が多かった。